インフルエンザの検査をすり抜けて
インフルエンザの感染が見逃され水面下でインフルエンザが一定の流行をし
コロナのPCR検査にインフルエンザが反応するという
ストーリーを成立させる方法論
あり得ない推論をしてみようか

SF小説的なフィクションをつくるとすれば
1従来の抗原検査に反応しない季節性インフルエンザでなければならない
 一部の医療機関で行われるPCR検査にも反応しないように
 
2 新型コロナウイルスのPCR検査に用いられているプライマーに
  反応するインフルエンザウイルスでなければならない

従来の抗原検査に反応しない抗原を産生する
インフルエンザウイルスに作り替えないといけない
インフルエンザを検知するPCR検査の各プライマーに反応しない
ウイルスに作り替えないといけない
新型コロナウイルスを検知するPCR検査のプライマーに反応する
インフルエンザウイルスでなければならない
そういう遺伝子操作をして新たなウイルスを作らないといけない。

それはもはや季節性インフルエンザではなく人工のウイルスだろうし
SF小説の世界ではないのか