汎用性の高いシンプルに強いカード(エネコンとか)と、テーマ専用のめっちゃ強いカード(急襲とか)を同じリミットにすることで、
テーマデッキは強カード入れられなくなり、逆にスタンダードやファンデッキは強カード入れられるようになる
だからバランスとれるって発想だと思う

強カード無制限だとそれ入れたテーマデッキがさらに強くなるだけ。強カード規制したらファンデッキがテーマデッキに追いつけなくなる
ってことになるしね