現地に行って5分経過させるのがセオリーだけど、コマンドが使えるなら
/kill @e[type=item]
でワールド中の落ちているアイテムすべて消せる
そもそも>>878の言うように読み込み範囲外の要素でラグは発生しないので他の要因が考えられる
一度ゲームを抜けて入り直す、表示設定を下げるなどしてみて