ヒエラルキーの構造変化に合わせて自動で修正してくれるツールはいくつかある
https://booth.pm/ja/items/4390605
手動で直すなら、animファイルはメモ帳で開けるから
置き換え機能でパスの部分を修正する事もできる、手間はかかるが数分で済むだろう
MMDワールドなんか使うな