キーボードのショートカットキーでフルスクリーン化してない？
ゲーム内オプションのみで設定していないとダメなケースがあった様な気がする
あと解像度（出力、ディスプレイ）が16：9や4:3以外の変則比だったりで
ソフト側（エンジン設定）が正規に対応してない場合も