それほど厳密なルールはなく、みなさんの良識に委ねてる感じですね

牛・羊あたりは多すぎて重いっていう意見が前にあったから大抵いつも拠点倉庫から多少離れたところでやってます
村人関連やGT等の放置施設はネザーゲート経由のわりと離れたところでやる方が多いかも
あとは共同物や他人の作ったものに対してある程度配慮してくだされば特に大きな問題は生じないはずと思います