基本1種類につき1匹まで残す
進化するポケモンであれば例えばポッポ・ピジョン・ピジョットと3匹並べるだけ
カイリキーやバンギラス等よく使うポケモンは例外的に数匹保有する
ラプラスやアンノーン、伝説系等人気のポケモンは数匹だけ交換用に残す

色違いも1種類につき1匹まで
色違いで余ったのはキャモメとか需要が無いのは即飴
ミニリュウ等人気の色違いは余ったら交換用にする

これでボックス1500で困ったことない