俺が田畑の立場だったら、まず通常の攻撃魔法からはフレンドリーファイアを無くす

次に「魔法クラフト時にこの材料を追加すると手軽に威力を上げられるが、フレンドリーファイアするようになってしまう」というアイテムを用意する

そしてもちろん、ノクトがフレンドリーファイア有りの魔法を手に持つとAIが勝手に着弾地点から逃げてくれるようにする

これだけでフレンドリーファイア問題は大幅に解決する
通常攻撃魔法なら狭いダンジョンでも使えるし
さらに魔法クラフト要素とも連動させる事ができる
AI処理も着弾地点から逃げるだけならそんなに重くないはず