PS2版
おすすめ:グラフィック、錬金で金策ができる
非おすすめ:錬金に時間(正確には歩数)がかかる、各地の錬金レシピが抽象的、
スキルを常時確認できずレベルアップ時に必ずスキルポイントを振らなければならない
3DS版
おすすめ:錬金が直ぐに完成する、スキルがいつでも確認できいつでもポイントを振ることができる
１つしか入手できなかったアイテムが複数入手できる
強化ボスダンジョンの追加、マルチェロの後日談追加、ドルマゲスの前日談追加
ゼシカエンド追加、モリーとゲルダの仲間追加
写真クエスト追加、後半のボスの強化
スキルの種が入手しやすくなった(特に狩りをしなくても全員450ポイント弱くらいにはなる)
非おすすめ:グラフィックが劣っている、錬金の金策が厳しくなった
ヤンガスの産廃化(メガザル要員)
PS2版はランダムエンカウント、3DS版はシンボルエンカウント(海を除く)