制作発表でタイトルのことはこう言ってた
>タイトルの“プレカトゥス”は、“祈った”という意味のラテン語の“precatus”の意味をもつ。自分の行いが良いことだと信じて“祈り”ながらも、一方でその正義が、世界にとっては罪になるのではないか? という本作のテーマに関わっている。
その“precatus”という言葉に“天秤”という言葉が合わされた『プレカトゥスの天秤』。タイトルには“正義と罪が揺れ動く”という意味が込められているのだという。

ストーリーで何か意味を持った名称というより物語全体の普遍的なテーマみたいな位置づけかと