いやサービス停止の根拠は「今特許を侵害してるから」だから、侵害が解消されたものに対してはそもそも効力はないよ
いくら心証が悪くてもそこはひっくり返らない

侵害していても停止は行き過ぎだからライセンス契約してあげなさいみたいな折衷案は出にくくなる