泥でauだけど、デレマスの経験上
・ブラウザ版は直のキャリア決済なのでWalletポイントが使える
アプリ版はGoogleストアの残高とGoogle Pointが使える(モバイル決済でもGoogle残高扱い)
・BGMやSEの有無(シャニにはあんまり関係ないｗ)
・各々のコインは独立してる

こんなとこかな
シャニの場合ジュエルは共有出来るだろうけど、バナコインとアプリ版のコインが独立になりそう