>>311
チャンクの狭間に飲まれるバグで消えるか死ぬかで村人はいなくなります
※このバグのほうは統合版でおきるようですが

なので、ここまで書かれている情報からすると壁の上か屋根の上か、
どこか湧きつぶしの甘い所に湧いたモンスターに殺されたか、
ことごとく壁に埋まって窒息しした疑いが濃厚です

村に近づいていないとのことですが、ひょっとして地下深くで行動し続けていましたか？
アイテムをたまたま拾ったゾンビやハスクはデスポーンせずに活動するので、
長時間地下で採掘している間に殺されたケースかもしれません

村人を確実に生き残らせるには、いざというときの繁殖用の村人を3〜4人、
明かりでの湧きつぶしと柵や塀による窒息対策をしっかり施した地下室に隔離するのをお勧めします

心が折れるほど難しく感じるのであれば、Wikiを参照しながらプレイしたほうがよいかもしれませんね