3.5万キロならエアクリーナーからエンジンまでの間のどこかで二次空気吸い込みの疑いもあるね。
特にインテークのOリングやエアクリのジョイントチューブ。
中古車購入で放置期間が長い経歴が有るかも知れないならキャブ内の詰まりも疑う。