既に捕まえて図鑑登録されているはずのポケモンが
「付近のようす」でシルエットとして表示されるのですが
これは捕獲済みのポケモンとは何か違う特徴があるんですか？

今現在の状況だと、ビードル、ヨマワル、サボネア、エレブーがシルエット表示されています