原因の一つはこれでは
https://community.wayfarer.nianticlabs.com/discussion/30674/niantic-is-making-location-edits-to-improve-map-quality

位置をずらして申請されてるスポットの位置調整の影響で
条件が合わなくなったポケストやジムが消えたりしてるって話

あとこれまでスポンサージムは条件外だったけど
通常ジムと同じ条件に含まれたせいで通常ジムが消えてるって話もあるけどどうだろう

俺のところは地方だけど今のところ消えたのはジム１つのみ、そのうち対象になるのか？