作者とDiscordでやり取りした結果、どうもFullHD解像度だと立体にならないらしい
完全に平面なら、Gamebananaに書いてあるd3dx.iniの設定（surface_createmode）を確認してみて
https://gamebanana.com/mods/465098

単純に立体感の強弱の問題ならd3dxdm.iniのdm_convergenceとdm_separationを調整するか、起動中にCtrl + F3～F6で調整可能