イシイのノーマルクラス用なら純正セッティングが標準。濃い症状は車体側の各部損耗によるものかも。可能ならばキャブ内部パーツ総入れ替え、エアクリエレメント、リートバルブ辺りまでリフレッシュしてみては?
あとはサイレンサーが250cc2気筒用の内径細い物に変更されている可能性もあるかも。