https://support.nintendo.co.jp/app/answers/detail/a_id/33820#
https://support.nintendo.co.jp/app/answers/detail/a_id/34125

・本体から離れすぎていませんか？

本体に近づいて改善するかお試しください。

・Joy-Conのバッテリー残量がなくなっていませんか？

Joy-Conを充電してください。

・本体やJoy-Conに、任天堂のライセンス商品ではないカバーなどを装着していませんか？

一度、カバーなどを取り除いてお試しください。
任天堂ライセンス商品についてはこちらをご覧ください。
本体とJoy-Conとは無線（Bluetooth）で接続しています。
そのため、電波を発信している機器など、電波干渉を引き起こす機器が本体に近づきすぎていると、Joy-Conとの通信が不安定になる 場合があります。

（電波干渉を引き起こす機器の例）
　・電子レンジ
　・コードレス電話
　・無線アクセスポイント
　・USB 3.0で動作している機器（※）

機器の電源をOFFにしたり、場所を移動したりして改善するかお試しください。

※一部の機器は、USB 3.0で動作させると電波干渉を引き起こすノイズを発生させる場合があります。

・本体を金属製のラックに設置していませんか？

本体とコントローラーの通信が妨げられている可能性があります。
本体をラックの外に出して症状が改善するかお試しください。